面向分子对接学生的在线工具 — 数分钟生成 Vina 报告
浏览器端 AutoDock Vina,集成 Meeko 受体/配体预处理。可用 holo PDB,或 apo 结构配合文献定义或预测口袋。批量 SMILES 对接、PDF 报告与构象导出——无需本地安装 Vina 或 Meeko。
Platform features
Automated Pipeline
End-to-end automated molecular docking: Meeko handles receptor and ligand PDB preparation, then AutoDock Vina scores poses — no manual PDBQT scripting.
Cloud-Native Vina Webserver
Run the full Vina webserver workflow in your browser. Zero local dependencies — no conda, Meeko, or RDKit install on your machine.
Professional Reports
Automated PDF result generation with affinity tables, interaction figures, and pose exports — ready for manuscripts and SAR write-ups.
本对接服务能做什么
面向课程作业与早期研究的自动化刚性受体对接。提交前请对照下方清单——尤其注意结合位点设置与 pose QC。
配置与校验
受体输入
PDB ID 下载或上传 .pdb。支持多链 PDB——在 Review 时为每个任务选择一条蛋白链。
配体输入
单个 SMILES 或批量筛选:每行一个 SMILES,或导入多记录 .sdf。平台上限 300 配体/任务;具体批量上限见定价(如 Free 3、Student 30、Research 100、Lab 300)。
运行前 Review
两步流程:先校验配置(0 积分),再对接。在消耗算力前发现蛋白、box 与配体问题。
配体预检
分子量、可旋转键与 Meeko TORSDOF,含清晰的 Vina 友好尺寸 warn/reject 阈值。
计算 ADMET
RDKit Lipinski、Veber、QED 摘要——校验与结果中均有(本地计算,无外部 API)。
结合位点选项
共晶配体自动 box;apo pocketeer 前三口袋;口袋残基锚点(如 214,226,245);可选自定义 XYZ box。box 中心远离蛋白时会警告。
3D box 预览
Review 时在 3Dmol 中查看受体与对接 box。Apo 结构会显示明确提示,请与文献对比。
更快重新校验
只改配体?蛋白/box 校验缓存在浏览器会话中——无需重新下载 PDB。
对接引擎
AutoDock Vina(刚性受体)
Meeko 受体/配体预处理,dimorphite-DL 在任务 pH 下质子化(默认 7.4),RDKit ETKDG + MMFF94。固定 Vina 参数(exhaustiveness 8,9 modes)。
并行批量对接
2 个以上配体的任务在服务器上最多 4 路并行 Vina。单个配体失败不会取消整批其余配体。
共晶 redock 检查
检测到结合配体时,可选与晶体构象的 RMSD sanity check。单配体默认开启;批量默认关闭(可在高级选项开启)。
可选金属
在清理后的受体中保留选定 HETATM 记录(如 ZN、MG)。
结果与交付物
每个配体前 3 构象
得分最高的 Vina modes 导出为 ZIP 中的 SDF/PDB 复合物。
构象质量与置信度
PoseBusters QC(Pass / Warn / Fail)及基础 fallback。构象置信度文本来自分差 + QC 降级规则。
蛋白–配体相互作用
优先 PLIP;PLIP 失败时用距离启发式 fallback。2D 相互作用图、结合位点总览 PNG、配体 2D 结构 PNG。
结合模式解读
基于亲和力、相互作用与构象分离的英文讨论段落——显示在结果页与 PDF 中。
PyMOL 发表用图
可选无头 PyMOL 光线追踪结合位点 PNG(cartoon + sticks)。在高级选项开启;批量任务仅渲染最佳命中。
批量筛选表
多配体任务:可排序表格,含亲和力、构象置信度、QC 与 ADMET 列(MW、Lipinski、QED)。
交互式 3D 查看器
在浏览器中查看蛋白–配体复合物并切换导出构象。
PDF 报告与 Methods 复制
下载含嵌入图的 PDF。一键复制英文 Methods 文本及带编号引用的引用段落,便于写入论文。
可选 AI 论文草稿
对接完成后可生成 Gemini 辅助的 Discussion + 图注草稿(+1 积分)。不能替代人工同行评议或专业编辑。
结果 ZIP(结构包)
下载 results.zip,含构象、复合物、图、ADMET/相互作用 JSON 与 run_manifest.json——详见本页 ZIP 说明。
批量对接报告长什么样
来自 PDB 6LU7(SARS-CoV-2 主蛋白酶(Mpro))的真实输出:三个 SMILES 在筛选表中排序,含 PLIP 相互作用、Pose QC,以及最佳命中的 PyMOL 结合位点图。

- 受体
- 6LU7 · chain A
- 最佳亲和力
- -6.21 kcal/mol
- 批量规模
- 3 个配体 · 3 个对接成功
- 最佳命中
- 奈玛特韦
AutoDock Vina 预测 CC(C)(C)C(NC(=O)C(F)(F)F)C(=O)N1CC2CC(C1)N2C(=O)C(F)(F)F 为中等结合(最佳得分 -6.21 kcal/mol)。 在筛选化合物中,CC(C)(C)C(NC(=O)C(F)(F)F)C(=O)N1CC2CC(C1)N2C(=O)C(F)(F)F 排名第一。 PLIP 预测的关键相互作用包括:与 ASN142A, GLN189A 形成 2 个氢键;与 ASN142A 等残基有疏水接触;与 HIS41A、THR26A 形成卤键。 配体周围口袋残基包括 ASN142A, GLN189A, HIS41A, THR26A。 多个对接构象得分接近,建议在结构文件中比较其他构象。 以上均为计算预测,实验验证(如 SPR、ITC 或细胞实验)前请勿作机制性结论。
| # | 化合物 | 亲和力 |
|---|---|---|
| 1 | 奈玛特韦 | -6.21 |
| 2 | 布洛芬 | -6.03 |
| 3 | 阿司匹林 | -5.05 |
结果 ZIP 里有什么?
每次对接完成后除网页报告与 PDF 外,都会提供 results.zip。ZIP 用于 PyMOL/Chimera、离线整理表格与复现实验;PDF 是同一次运行的可读摘要,不能替代 ZIP 中的结构文件。
PDF 报告:亲和力、Pose QC、相互作用图等便于打印;完整结构与 JSON 数据请以 ZIP 为准。
任务根目录(整单一份)
- result.json
- 对接成功/失败配体汇总、分数与 redock 状态。
- run_manifest.json
- 可复现记录:流水线版本、Vina 参数、口袋/box、pH、蛋白链、warnings 等。
- receptor_clean.pdb
- 用于对接的预处理受体(刚性、清理后的 PDB)。
- redock_report.json
- 共晶 redock RMSD 校验(单配体或开启时才有)。
每个成功对接的配体
- poses/{配体名}.sdf
- Vina 得分最高的 3 个构象(多记录 SDF)。
- complexes/{配体名}_complex.pdb
- 蛋白–配体复合物,供 3D 软件打开。
- ligands/{配体名}/
- 配体 PDBQT、对接后 PDBQT、质子化 SMILES。
- admet/{配体名}.json
- RDKit Lipinski、Veber、QED 等计算 ADMET。
- interactions/{配体名}.json
- PLIP 相互作用表(失败时用距离启发式 fallback)。
- figures/{配体名}/
- 2D 相互作用图、结合位点总览 PNG、配体 2D 结构图;若开启 PyMOL 则含 pymol_binding_site.png(批量任务通常为得分最高者)。
不包含
以下需外部工具、手工操作或未来付费 tier——不在本自动化流程内。
计算分数、构象、ADMET 与相互作用仅为模型预测。在论文或报告中下结论前,请务必用实验与文献验证结合模式与成药性。
计算分数、构象、ADMET 与相互作用仅为模型预测。在论文或报告中下结论前,请务必用实验与文献验证结合模式与成药性。
开源软件栈与引用
MolecularDocking.online 采用有据可查、可引用的流水线——并非黑箱。每次任务会在 run_manifest.json 及结果报告中记录确切软件版本。撰写论文 Methods 时,可使用结果页的一键引用段落。
流水线 v1.9.4 · 下表为典型默认版本;您任务的 manifest 列有实际构建版本。
| 组件 | 版本 | 开发者 / 机构 | 用途 | 引用 |
|---|---|---|---|---|
AutoDock Vina | 1.2.7 | Scripps Research / community fork | 刚性受体分子对接 | [2] |
Meeko | 0.7.1 | Scripps Research (Forli lab) | 受体与配体 PDBQT 预处理 | [3] |
RDKit | 2025.3.6 | Open-source cheminformatics toolkit | SMILES → 3D 嵌入(ETKDG)与 MMFF94 最小化 | [4] |
PLIP | 3.0.0 | University of Hamburg (Salokas et al.) | 蛋白–配体相互作用分析 | [5] |
PoseBusters | 0.6.5 | University of Oxford (Buttenschoen et al.) | 对接构象质量校验(dock 配置) | [6] |
dimorphite-DL | 2.0.2 | Open-source protonation enumerator | 任务 pH 下配体质子化状态 | [7] |
Biopython | 1.87 | Open-source bioinformatics library | 结构解析与受体处理 | [8] |
pocketeer | 0.3.1 | Apo binding-site prediction | Apo 受体预测口袋排序 | [9] |
参考文献
- MolecularDocking.online. MolecularDocking.online. Cloud molecular docking workflow (https://molecular-docking.online). Accessed 2026.
- AutoDock Vina. Eberhardt J, Santos-Martins D, Forli S, Olson AJ. AutoDock Vina 1.2.0: new docking methods, expanded force field, and Python bindings. J Chem Inf Model. 2021;61(8):3891-3898.
- Meeko / AutoDock suite. Forli S, Huey R, Pique ME, Sanner MF, Olson AJ. Computational protein-ligand docking and virtual drug screening with the AutoDock suite. Nat Protoc. 2016;11(5):905-919.
- RDKit. RDKit: Open-source cheminformatics. https://www.rdkit.org/ (accessed 2024).
- PLIP. Salokas LM, Viswanath S, Aho AJ, et al. PLIP 2021: expanding the scope of the protein-ligand interaction profiler to DNA and RNA. Nucleic Acids Res. 2023;51(W1):W530-W534.
- PoseBusters. Buttenschoen GF, Morris GM, Deane CM. PoseBusters: AI-based docking methods fail to generate physically valid poses or cause unintended bias. Nat Methods. 2024;21(3):472-480.
- dimorphite-DL. Swain M. dimorphite-DL: an open-source program for enumerating the ionization states of drug-like small molecules. J Cheminform. 2019;11(1):14.
- Biopython. Cock PA, Antao T, Chang JT, et al. Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics. Bioinformatics. 2009;25(11):1422-1423.
- pocketeer. pocketeer: apo binding-site prediction tool used for pocket ranking in this pipeline.
实用指南 — 面向您的 对接课程作业
从选择蛋白结构到撰写 Methods 段落的完整教程——足够清晰用于实验报告,足够精简应对截止日期。
是否需要晶体结构?
何时需要 holo PDB,何时 apo 结构加预测口袋可行,以及如何在报告中说明选择理由。
Read article如何解读对接分数与构象
kcal/mol 亲和力、构象质量检查,以及 Vina 分数在实验报告中能说明什么、不能说明什么。
Read article首次对接,分步指南
下载 PDB、准备配体、运行 Vina、检查构象,并为作业撰写 Methods 段落。
Read article在云端运行 Vina
何时浏览器工作流优于本地安装——配置、限制与学生预算预期。
Read article毒理学与 ADMET 报告中的对接
在毒理学课程作业中结合对接与 in silico ADMET 预测。
Read article学生学习对接路线图
四周计划:结构、Vina、可视化与批判性阅读结果。
Read article谁在使用 Dock?
专为「在线分子对接」「AutoDock Vina 在线」「学生分子对接软件」「虚拟筛选模拟」等需求而设计。
药物化学与药学
解答「如何进行分子对接」:批量 SMILES、Vina 评分排序、相互作用图,直接用于实验报告中的 SAR 分析。
毒理学与 ADMET 课程
将配体对接到靶标,结合内置 RDKit ADMET 标记与相互作用表,在报告中讨论脱靶风险与类药性。
生物化学与结构生物学
在论文中解释分子对接的含义:刚性受体 Vina、结合亲和力、构象质量,以及与实验方法的局限性对比。
在线对接 vs 本地安装
跳过笔记本上的 conda、Meeko 与 PyMOL 脚本——同样的 AutoDock Vina 引擎,浏览器工作流,导出 ZIP + PDF 用于提交。
学习分子对接
从我们的指南开始:晶体结构、结合位点、对接模拟原理——然后运行免费的 Review setup(0 积分)。
虚拟筛选与命中列表
运行小型化合物库对接模拟(20–100 个配体),比较排序构象与亲和力,导出 CSV/ZIP 用于筛选作业与先导化合物优先级报告。
深受学生信赖,覆盖药物化学与结构生物学
“我们小组一周内要对接 30 个 NSAID 类似物。我先用 Review setup,再跑一个批量任务——拿到了助教真正想要的 PDF 和构象文件。”
“以前每个周日晚上都在修 Meeko。这里粘贴 SMILES,用 Student 方案积分付费,周一早上就有了 PLIP 表格用于幻灯片。”
“Redock 检查在浪费积分前发现了错误的链 ID。PDB 损坏时失败任务自动退款——这保住了我的预算。”
Dock 积分与方案
中国大陆用户暂通过微信扫码转账购买积分。备注只写邮箱,新用户默认密码 123456,约 30 分钟内生效。
各层级相同的对接交付物:setup review · Vina(前 3 构象)· 构象 QC · PLIP · ADMET · PDF/ZIP。可选 PyMOL 图(+0.5 积分/任务)。
适合 1–3 个配体的小作业
- 2 积分(一次性)
- 完整对接流水线:Vina · PLIP · ADMET · PDF/ZIP
- 付款后约 30 分钟内人工到账
适合多次对接或小型批量筛选
- 10 积分(一次性)
- 完整对接流水线:Vina · PLIP · ADMET · PDF/ZIP
- 付款后约 30 分钟内人工到账
海外用户请使用英文站的 PayPal / 银行卡订阅与积分包。
Dock 积分如何运作
积分用于每次对接运行。订阅包含月度积分;一次性积分包为固定价格单独购买(见定价页)。两者可共存于同一账户。
每次对接运行消耗的积分
点击 Run docking 时,按配体数量从余额扣除积分——无论积分来自 Free、订阅还是一次性积分包。本节说明积分消耗,而非一次性积分包价格。
一次性积分包(Single Run、Screening Pack)在定价页「一次性」标签以固定价格出售,捆绑一定积分。结账时不按配体计费——下表说明每次运行对接时积分的使用方式。
- 1–3 个配体:1 积分
- 4+ 个配体:每 5 个配体 1 积分,向上取整(4–5 个配体 = 1 积分;12 个配体 = 3 积分)
- PyMOL 发表级图:+0.5 积分/任务(可选)
- 可选 AI 论文草稿(Gemini Discussion + 图注):+1 积分,对接完成后单独生成时计费
- 示例:25 个配体 + PyMOL = 5 + 0.5 = 5.5 积分
每次运行消耗积分(参考)
| 配体数 | 积分 | + PyMOL |
|---|---|---|
| 1 | 1 | 1.5 |
| 2 | 1 | 1.5 |
| 3 | 1 | 1.5 |
| 4 | 1 | 1.5 |
| 5 | 1 | 1.5 |
PyMOL 每任务 +0.5 积分。AI 论文草稿 +1 积分,对接后单独计费。适用于任何积分余额(Free、订阅或一次性)。其他批量规模:1–3 个配体 = 1 积分;4+ = 每 5 个配体 1 积分(向上取整)。
积分何时扣除
- 提交对接任务时扣除积分(非完成时)
- 始终优先使用订阅积分;当期订阅积分用尽后才使用一次性积分包积分
- Free 方案:注册时一次性发放 1 积分(足够一次 1–3 配体任务,不含 PyMOL);未用积分不结转,且不会每月刷新。每邮箱一次积分发放;每设备与网络仅限一个 Free 账户。
- 付费方案:月度订阅积分在每个计费周期开始时重置
升级订阅
- 升级时(如 Student → Research),旧订阅自动取消——不会同时保留两个付费方案
- 旧方案未用尽的订阅积分不结转;新方案以完整月度额度开始(如 Research = 40 积分)
- 单独购买的一次性积分包积分在升级时不移除——保留在账户中直至使用
订阅与一次性积分包并存
- 可同时购买订阅与一次性积分包——两者均保留在账户中
- 一次性积分包:Single Run(2 积分)、Screening Pack(8 积分)。积分加入已购余额,按上述规则每次运行消耗
- 一次性积分包积分不随月度周期过期;订阅积分每个计费周期重置(Free 注册积分为一次性,不按月发放)
- 任务始终先消耗订阅积分,再消耗一次性积分
- 需要更多月度用量时建议订阅或升级;一次性积分包始终在定价页作为备选
服务故障与积分退款
对接在我们的服务器上运行;您支付积分以执行计算并获取报告/ZIP。配体对接不成功(无效结构、预处理错误、无可用构象或单配体超时)属于正常科学结果——任务仍交付结果,积分不退还。若批量任务达到 3 小时上限,已完成配体以部分 ZIP 交付;未完成配体标记为 skipped——无部分积分退款。服务故障指平台无法完成或交付报告/ZIP(系统错误、崩溃或交付前超时)。此时该任务所扣积分全额自动退还(见积分历史)。批量任务提交时一次性按整批计费。订阅付款与任务积分分开。
结果存储
已完成任务按方案存储:Free 7 天,Student 14 天,Research 30 天,Lab 90 天。到期后文件删除——请本地保存 ZIP/PDF。Free 用户可从控制台延长一次或两次(每次 +14 天,0.5 积分)。
常见问题
Dock 如何处理配体质子化、加氢与部分电荷?
配体在任务质子化 pH(默认 7.4,可调 4.0–10.0)下由 dimorphite-DL 离子化。RDKit 3D 嵌入(ETKDGv3,多种子重试)时添加显式氢,随后 MMFF94 最小化(UFF 备用)。Meeko MoleculePreparation 在写入配体 PDBQT 时分配 AutoDock 原子类型与部分电荷。质子化 SMILES、pH、优化器与预处理警告记录在 run_manifest.json 中,并出现在 PDF Methods 部分。
是否支持具有大量可旋转键的配体?
支持,在 AutoDock Vina 刚性受体对接的合理范围内。Meeko 在配体 PDBQT 中标记每个非末端可旋转键(报告为 TORSDOF)。Review setup 在超过 12 个可旋转键或 TORSDOF 时警告,超过 20 则拒绝。高柔性配体可能运行缓慢或构象采样不完整——可考虑更刚性类似物或其他平台的诱导契合方法。分子量上限 900 Da(超过 600 Da 警告)。
端到端对接流程是什么?
受体:RCSB PDB 下载(4 字符 PDB ID,如 6LU7)或用户上传 → Biopython 清理(去除水与共晶配体;可选保留 ZN/MG HETATM)→ Meeko Polymer 刚性受体 PDBQT。配体:SMILES 或 SDF → dimorphite-DL 质子化 → RDKit 3D 构象 → Meeko 配体 PDBQT。对接:AutoDock Vina(exhaustiveness 8,九种模式,energy range 3 kcal/mol),每个配体导出前三个构象。后处理:PLIP 蛋白-配体相互作用、PoseBusters 构象 QC、RDKit Lipinski/Veber/QED 摘要。
受体是否柔性,还是仅配体柔性?
仅刚性受体对接:Meeko 受体预处理后蛋白侧链保持固定。配体柔性遵循 Meeko 可旋转键根(PDBQT 中的 TORSDOF)。本流程不支持诱导契合对接、柔性侧链、共价对接与膜蛋白工作流。
AutoDock Vina 搜索盒如何定义?
Review setup 时可选四种盒来源:(1) 共晶配体质心(holo 结构),(2) apo 口袋预测(pocketeer — 可选前三个口袋),(3) 口袋残基锚点(如 214,226,245),(4) 自定义 XYZ 中心。默认盒尺寸 20 × 20 × 20 Å。3D 预览在消耗积分前显示受体与搜索盒。Apo 口袋预测含明确免责声明,建议与文献或共晶结构对比。
Review setup(0 积分)在对接前验证什么?
Review setup 解析或下载受体、确定结合盒,并对配体运行预检(SMILES 有效性、分子量、可旋转键数、Meeko TORSDOF)及 3D 盒预览——不扣积分。此处生成的配体 PDBQT 在对接时复用(质子化锁定于验证步骤)。修复显示的错误后,Run docking 仅在提交时扣积分。
AutoDock Vina 设置是否固定?能否修改 exhaustiveness?
Vina 参数为可重复性固定:exhaustiveness = 8,num_modes = 9,energy_range = 3 kcal/mol,scoring function vina。每个配体导出评分最低的三个构象为 SDF 与蛋白-配体复合物 PDB。不支持自定义 exhaustiveness、Smina 或 GNINA 重评分——版本字符串与全部设置记录在 run_manifest.json 中,供 Methods 段落引用。
共晶 redock 健全性检查如何工作?
当上传 PDB 中存在共晶配体时,Dock 可对其 redock 并报告与晶体构象的重原子 RMSD。单配体任务默认启用;批量任务默认禁用(可在 Advanced 启用)。大 RMSD 在筛选类似物前提示结合盒设置错误、链选择错误或质子化不匹配。
分子对接是否一定需要晶体化蛋白结构?
不一定。Holo 晶体结构(蛋白与共晶配体)最适合定义结合位点与 redock 检查。许多学生项目可用 apo 结构加文献定义或预测口袋,前提是清楚说明假设。
分子对接如何工作?
在结合位点放置搜索网格;采样配体构象并由搜索算法评分。AutoDock Vina 使用刚性受体对接(蛋白固定,配体扭转柔性)。Dock 用 Meeko 准备受体与配体 PDBQT,并将 Vina 设置、盒坐标与质子化 pH 记录在 run_manifest.json 与 PDF 报告中。
学生最适合的分子对接软件是什么?
AutoDock Vina 仍是教学实验室标准(快速、引用广泛)。Dock 在线运行 Vina,免去本地安装。GNINA 或 DiffDock 等替代方案增加 ML 评分,但设置与可重复性不同——大多数作业,Vina 加清晰 Methods 文字即符合评分预期。
如何在线运行分子对接?
输入 4 字符 PDB ID(或上传 .pdb 受体),提交 SMILES 或 SDF 配体,运行 Review setup(0 积分),然后点击 Run docking。您将收到 results.zip 包与 PDF 报告,含构象、PLIP 相互作用、构象 QC 及可选 PyMOL 图。
results ZIP 文件包含什么?
results.zip 是离线工作的完整交付物。任务根目录:result.json(摘要)、run_manifest.json(Methods 用 Vina/盒/pH)、receptor_clean.pdb,适用时含 redock_report.json。每个已对接配体:前 3 构象(SDF)、蛋白-配体复合物(PDB)、配体 PDBQT、ADMET 与相互作用 JSON、PNG 图(2D diagram、overview、ligand 2D;可选 PyMOL 结合位点渲染)。PDF 报告镜像关键表格与图用于打印,但不替代 ZIP 结构文件。见首页 Features 下「results ZIP 包含什么」一节。
单配体 vs 批量:报告是否相同?所有化合物在哪里显示?
每个成功配体的流程相同——均有构象、复合物 PDB、ADMET JSON、相互作用 JSON 与 PNG 图。results.zip 中每个成功对接化合物有独立文件(不仅是最佳命中)。网页报告中结果表列出所有配体及评分与 QC;结合模式文字、发表级图、ADMET 详情与 3D 查看器一次显示一个配体——批量任务使用配体下拉(默认:最佳亲和力)。PDF 在表中列出所有配体,但主要嵌入最佳命中的图与讨论。可选 AI 手稿草稿也聚焦最佳命中。例外:批量任务启用 PyMOL 图时,仅最佳命中获得 PyMOL PNG(其他每配体交付物仍适用)。共晶 redock 单配体默认开启,批量筛选默认关闭。
对接任务的积分如何计算?
对接运行:1–3 个配体 1 积分,之后每 5 个配体 1 积分向上取整(4–5 = 1 积分,6–10 = 2 积分,依此类推)。可选 PyMOL 图每任务 +0.5 积分。点击 Run docking 时检查积分,任务入队前验证。
积分何时扣除?
提交对接任务时扣除积分,非完成时。仅当服务未能交付报告/ZIP(系统错误、崩溃或超时)时退款——单个配体无法对接不属于退款范围。
配体无法对接是否等于服务故障?
否。配体无法对接表示流程已运行但该分子无法预处理或评分(错误 SMILES、预处理错误、单配体超时等)——这是您付费测试的正常结果,积分不退。若批量达到 3 小时上限,您收到已完成配体的部分 ZIP;skipped 化合物列于报告中——仍无部分退款。服务故障指平台无法完成或交付任务(服务器错误、崩溃、无报告/ZIP 的超时)。服务故障全额退款。已完成批量中部分配体 skipped 仍属已交付任务——无部分退款。
何时退还积分?
仅服务故障:系统错误、崩溃或交付任何报告/ZIP 前的超时。查看控制台 → 积分历史中的退款记录。修复输入后重新提交。配体级别结果(无法对接、弱亲和力)不退款。
批量中部分配体无法对接,是否退还积分?
否。提交时按整批一次性扣积分。Skipped、超时或无法对接的配体是正常结果,列于报告中——不构成退款理由。若任务达到 3 小时上限,您仍收到已完成配体的部分 ZIP。仅当整批任务在我方侧完全失败且无交付物时退款。
订阅积分 vs 一次性积分包积分?
订阅积分每个计费周期重置,属于当前方案。一次性积分包(Single Run、Screening Pack)单独购买,不随月份过期,升级时不移除。运行任务时始终先用订阅积分;当期订阅积分用尽后才用一次性积分。
升级订阅会发生什么?
旧订阅自动取消——不会同时保留两个付费方案。旧方案未用订阅积分不结转;新方案以完整月度额度开始(如升级至 Research 得 40 积分)。单独购买的一次性积分包积分保留。升级前控制台会要求确认。
Dock 费用多少?
Dock 提供 Free 方案 $0/月(1 积分/月,无需信用卡)。付费月度订阅:Student $12/月(10 积分/月),Research $35/月(40 积分/月,2 并发,优先队列),Lab $99/月(150 积分/月,5 并发,优先队列)。无订阅的一次性积分包:Single Run $7.99(2 积分)与 Screening Pack $19.99(8 积分)。所有付费层级包含相同对接流程(Vina、PLIP、ADMET、PDF/ZIP)。定价与限制与本页定价部分所示一致。
Student、Research、Lab 方案包含什么?
Student($12/月):10 积分/月。Research($35/月):40 积分/月,2 并发,优先队列。Lab($99/月):150 积分/月,5 并发。批量规模由积分限制(每任务最多 300 配体)。所有方案包含完整对接流程。详见定价页。
能否不订阅直接购买积分?
可以。Single Run($7.99):2 积分。Screening Pack($19.99):8 积分。积分按配体数量每次运行消耗;并发与队列优先级遵循方案层级(见定价页)。
订阅退款政策是什么?
可随时取消订阅以停止未来扣款。过往订阅付款通常不退款,法律要求除外。对接任务积分分开:仅服务故障(未交付报告/ZIP)自动退款,配体无法对接不退款。
结果保留多久?
保留期取决于方案:Free 7 天,Student 14 天,Research 30 天,Lab 90 天。Free 用户可从控制台延长已完成任务两次(每次 +14 天,0.5 积分)。过期前请下载 ZIP 与 PDF。
平台活动
来自生产环境的公开指标——无营销包装。
数据来自生产日志 · 最近更新 2026 年 6 月