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D
Dock

面向分子对接学生的在线工具 — 数分钟生成 Vina 报告

浏览器端 AutoDock Vina,集成 Meeko 受体/配体预处理。可用 holo PDB,或 apo 结构配合文献定义或预测口袋。批量 SMILES 对接、PDF 报告与构象导出——无需本地安装 Vina 或 Meeko。

AutoDock Vina 在线

分子对接工具与云端模拟——无需本地安装

晶体结构可选

Holo PDB、文献位点或预测口袋

操作指南

概念、工作流与报告撰写教程

AutoDock Vina 对接流程

运行分子对接

免费 Review setup(0 积分),检查通过后运行对接。 查看完整能力清单

1

蛋白(受体)

使用 RCSB 的 PDB ID,或上传已清理的结构文件。

指定要下载并准备用于对接的受体结构。

RCSB 四位编号,如 6LU7

2

配体

对接单个化合物,或对同一受体批量筛选多个 SMILES。

需要 SMILES?在 PubChem 搜索并复制 Canonical SMILES。

用于 3D 预处理与 AutoDock Vina 对接的化学结构。

示例:乙醇为 CCO

仅作内部文件标签;报告与表格以 SMILES 标识化合物。

留空则默认为 ligand_1

质子化 pH(默认 7.4). 保留 HETATM — 辅因子/金属(如 ZN、MG). 共晶 redock 检查. PyMOL 发表用渲染. 自定义对接盒(XYZ 中心与尺寸). 口袋残基锚点

Secure, private-focused cloud pipeline. Your data is processed securely and cleared immediately after job completion.

0 积分 — 验证受体、结合位点与全部配体

提交时按配体数量与可选 PyMOL(+0.5)扣积分。详见 积分如何运作.

请登录以检查配置并运行对接。

Platform features

Automated Pipeline

End-to-end automated molecular docking: Meeko handles receptor and ligand PDB preparation, then AutoDock Vina scores poses — no manual PDBQT scripting.

Cloud-Native Vina Webserver

Run the full Vina webserver workflow in your browser. Zero local dependencies — no conda, Meeko, or RDKit install on your machine.

Professional Reports

Automated PDF result generation with affinity tables, interaction figures, and pose exports — ready for manuscripts and SAR write-ups.

对接服务能做什么

面向课程作业与早期研究的自动化刚性受体对接。提交前请对照下方清单——尤其注意结合位点设置与 pose QC。

配置与校验

  • 受体输入

    PDB ID 下载或上传 .pdb。支持多链 PDB——在 Review 时为每个任务选择一条蛋白链。

  • 配体输入

    单个 SMILES 或批量筛选:每行一个 SMILES,或导入多记录 .sdf。平台上限 300 配体/任务;具体批量上限见定价(如 Free 3、Student 30、Research 100、Lab 300)。

  • 运行前 Review

    两步流程:先校验配置(0 积分),再对接。在消耗算力前发现蛋白、box 与配体问题。

  • 配体预检

    分子量、可旋转键与 Meeko TORSDOF,含清晰的 Vina 友好尺寸 warn/reject 阈值。

  • 计算 ADMET

    RDKit Lipinski、Veber、QED 摘要——校验与结果中均有(本地计算,无外部 API)。

  • 结合位点选项

    共晶配体自动 box;apo pocketeer 前三口袋;口袋残基锚点(如 214,226,245);可选自定义 XYZ box。box 中心远离蛋白时会警告。

  • 3D box 预览

    Review 时在 3Dmol 中查看受体与对接 box。Apo 结构会显示明确提示,请与文献对比。

  • 更快重新校验

    只改配体?蛋白/box 校验缓存在浏览器会话中——无需重新下载 PDB。

对接引擎

  • AutoDock Vina(刚性受体)

    Meeko 受体/配体预处理,dimorphite-DL 在任务 pH 下质子化(默认 7.4),RDKit ETKDG + MMFF94。固定 Vina 参数(exhaustiveness 8,9 modes)。

  • 并行批量对接

    2 个以上配体的任务在服务器上最多 4 路并行 Vina。单个配体失败不会取消整批其余配体。

  • 共晶 redock 检查

    检测到结合配体时,可选与晶体构象的 RMSD sanity check。单配体默认开启;批量默认关闭(可在高级选项开启)。

  • 可选金属

    在清理后的受体中保留选定 HETATM 记录(如 ZN、MG)。

结果与交付物

  • 每个配体前 3 构象

    得分最高的 Vina modes 导出为 ZIP 中的 SDF/PDB 复合物。

  • 构象质量与置信度

    PoseBusters QC(Pass / Warn / Fail)及基础 fallback。构象置信度文本来自分差 + QC 降级规则。

  • 蛋白–配体相互作用

    优先 PLIP;PLIP 失败时用距离启发式 fallback。2D 相互作用图、结合位点总览 PNG、配体 2D 结构 PNG。

  • 结合模式解读

    基于亲和力、相互作用与构象分离的英文讨论段落——显示在结果页与 PDF 中。

  • PyMOL 发表用图

    可选无头 PyMOL 光线追踪结合位点 PNG(cartoon + sticks)。在高级选项开启;批量任务仅渲染最佳命中。

  • 批量筛选表

    多配体任务:可排序表格,含亲和力、构象置信度、QC 与 ADMET 列(MW、Lipinski、QED)。

  • 交互式 3D 查看器

    在浏览器中查看蛋白–配体复合物并切换导出构象。

  • PDF 报告与 Methods 复制

    下载含嵌入图的 PDF。一键复制英文 Methods 文本及带编号引用的引用段落,便于写入论文。

  • 可选 AI 论文草稿

    对接完成后可生成 Gemini 辅助的 Discussion + 图注草稿(+1 积分)。不能替代人工同行评议或专业编辑。

  • 结果 ZIP(结构包)

    下载 results.zip,含构象、复合物、图、ADMET/相互作用 JSON 与 run_manifest.json——详见本页 ZIP 说明。

样例报告
示意数据 · 非您的任务

批量对接报告长什么样

来自 PDB 6LU7(SARS-CoV-2 主蛋白酶(Mpro))的真实输出:三个 SMILES 在筛选表中排序,含 PLIP 相互作用、Pose QC,以及最佳命中的 PyMOL 结合位点图。

PyMOL — 奈玛特韦 · 6LU7
PyMOL · 最佳命中
受体
6LU7 · chain A
最佳亲和力
-6.21 kcal/mol
批量规模
3 个配体 · 3 个对接成功
最佳命中
奈玛特韦

AutoDock Vina 预测 CC(C)(C)C(NC(=O)C(F)(F)F)C(=O)N1CC2CC(C1)N2C(=O)C(F)(F)F 为中等结合(最佳得分 -6.21 kcal/mol)。 在筛选化合物中,CC(C)(C)C(NC(=O)C(F)(F)F)C(=O)N1CC2CC(C1)N2C(=O)C(F)(F)F 排名第一。 PLIP 预测的关键相互作用包括:与 ASN142A, GLN189A 形成 2 个氢键;与 ASN142A 等残基有疏水接触;与 HIS41ATHR26A 形成卤键。 配体周围口袋残基包括 ASN142A, GLN189A, HIS41A, THR26A。 多个对接构象得分接近,建议在结构文件中比较其他构象。 以上均为计算预测,实验验证(如 SPR、ITC 或细胞实验)前请勿作机制性结论。

#化合物亲和力
1奈玛特韦-6.21
2布洛芬-6.03
3阿司匹林-5.05
查看完整样例报告用您自己的结构试一试

仅为计算预测——在论文或报告中下结论前请验证结合模式。

结果 ZIP 里有什么?

每次对接完成后除网页报告与 PDF 外,都会提供 results.zip。ZIP 用于 PyMOL/Chimera、离线整理表格与复现实验;PDF 是同一次运行的可读摘要,不能替代 ZIP 中的结构文件。

PDF 报告:亲和力、Pose QC、相互作用图等便于打印;完整结构与 JSON 数据请以 ZIP 为准。

任务根目录(整单一份)

result.json
对接成功/失败配体汇总、分数与 redock 状态。
run_manifest.json
可复现记录:流水线版本、Vina 参数、口袋/box、pH、蛋白链、warnings 等。
receptor_clean.pdb
用于对接的预处理受体(刚性、清理后的 PDB)。
redock_report.json
共晶 redock RMSD 校验(单配体或开启时才有)。

每个成功对接的配体

poses/{配体名}.sdf
Vina 得分最高的 3 个构象(多记录 SDF)。
complexes/{配体名}_complex.pdb
蛋白–配体复合物,供 3D 软件打开。
ligands/{配体名}/
配体 PDBQT、对接后 PDBQT、质子化 SMILES。
admet/{配体名}.json
RDKit Lipinski、Veber、QED 等计算 ADMET。
interactions/{配体名}.json
PLIP 相互作用表(失败时用距离启发式 fallback)。
figures/{配体名}/
2D 相互作用图、结合位点总览 PNG、配体 2D 结构图;若开启 PyMOL 则含 pymol_binding_site.png(批量任务通常为得分最高者)。

不包含

以下需外部工具、手工操作或未来付费 tier——不在本自动化流程内。

计算分数、构象、ADMET 与相互作用仅为模型预测。在论文或报告中下结论前,请务必用实验与文献验证结合模式与成药性。

计算分数、构象、ADMET 与相互作用仅为模型预测。在论文或报告中下结论前,请务必用实验与文献验证结合模式与成药性。

开源软件栈与引用

MolecularDocking.online 采用有据可查、可引用的流水线——并非黑箱。每次任务会在 run_manifest.json 及结果报告中记录确切软件版本。撰写论文 Methods 时,可使用结果页的一键引用段落。

流水线 v1.9.4 · 下表为典型默认版本;您任务的 manifest 列有实际构建版本。

组件版本开发者 / 机构用途引用
AutoDock Vina
1.2.7Scripps Research / community fork刚性受体分子对接[2]
Meeko
0.7.1Scripps Research (Forli lab)受体与配体 PDBQT 预处理[3]
RDKit
2025.3.6Open-source cheminformatics toolkitSMILES → 3D 嵌入(ETKDG)与 MMFF94 最小化[4]
PLIP
3.0.0University of Hamburg (Salokas et al.)蛋白–配体相互作用分析[5]
PoseBusters
0.6.5University of Oxford (Buttenschoen et al.)对接构象质量校验(dock 配置)[6]
dimorphite-DL
2.0.2Open-source protonation enumerator任务 pH 下配体质子化状态[7]
Biopython
1.87Open-source bioinformatics library结构解析与受体处理[8]
pocketeer
0.3.1Apo binding-site predictionApo 受体预测口袋排序[9]

参考文献

  1. MolecularDocking.online. MolecularDocking.online. Cloud molecular docking workflow (https://molecular-docking.online). Accessed 2026.
  2. AutoDock Vina. Eberhardt J, Santos-Martins D, Forli S, Olson AJ. AutoDock Vina 1.2.0: new docking methods, expanded force field, and Python bindings. J Chem Inf Model. 2021;61(8):3891-3898.
  3. Meeko / AutoDock suite. Forli S, Huey R, Pique ME, Sanner MF, Olson AJ. Computational protein-ligand docking and virtual drug screening with the AutoDock suite. Nat Protoc. 2016;11(5):905-919.
  4. RDKit. RDKit: Open-source cheminformatics. https://www.rdkit.org/ (accessed 2024).
  5. PLIP. Salokas LM, Viswanath S, Aho AJ, et al. PLIP 2021: expanding the scope of the protein-ligand interaction profiler to DNA and RNA. Nucleic Acids Res. 2023;51(W1):W530-W534.
  6. PoseBusters. Buttenschoen GF, Morris GM, Deane CM. PoseBusters: AI-based docking methods fail to generate physically valid poses or cause unintended bias. Nat Methods. 2024;21(3):472-480.
  7. dimorphite-DL. Swain M. dimorphite-DL: an open-source program for enumerating the ionization states of drug-like small molecules. J Cheminform. 2019;11(1):14.
  8. Biopython. Cock PA, Antao T, Chang JT, et al. Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics. Bioinformatics. 2009;25(11):1422-1423.
  9. pocketeer. pocketeer: apo binding-site prediction tool used for pocket ranking in this pipeline.

谁在使用 Dock?

专为「在线分子对接」「AutoDock Vina 在线」「学生分子对接软件」「虚拟筛选模拟」等需求而设计。

药物化学与药学

解答「如何进行分子对接」:批量 SMILES、Vina 评分排序、相互作用图,直接用于实验报告中的 SAR 分析。

毒理学与 ADMET 课程

将配体对接到靶标,结合内置 RDKit ADMET 标记与相互作用表,在报告中讨论脱靶风险与类药性。

生物化学与结构生物学

在论文中解释分子对接的含义:刚性受体 Vina、结合亲和力、构象质量,以及与实验方法的局限性对比。

在线对接 vs 本地安装

跳过笔记本上的 conda、Meeko 与 PyMOL 脚本——同样的 AutoDock Vina 引擎,浏览器工作流,导出 ZIP + PDF 用于提交。

学习分子对接

从我们的指南开始:晶体结构、结合位点、对接模拟原理——然后运行免费的 Review setup(0 积分)。

虚拟筛选与命中列表

运行小型化合物库对接模拟(20–100 个配体),比较排序构象与亲和力,导出 CSV/ZIP 用于筛选作业与先导化合物优先级报告。

深受学生信赖,覆盖药物化学与结构生物学

我们小组一周内要对接 30 个 NSAID 类似物。我先用 Review setup,再跑一个批量任务——拿到了助教真正想要的 PDF 和构象文件。

Maya K.
药物化学硕士,英国

以前每个周日晚上都在修 Meeko。这里粘贴 SMILES,用 Student 方案积分付费,周一早上就有了 PLIP 表格用于幻灯片。

James R.
生物化学本科生,美国

Redock 检查在浪费积分前发现了错误的链 ID。PDB 损坏时失败任务自动退款——这保住了我的预算。

Sofia L.
计算药学 PhD 候选人

Dock 积分与方案

中国大陆用户暂通过微信扫码转账购买积分。备注只写邮箱,新用户默认密码 123456,约 30 分钟内生效。

各层级相同的对接交付物:setup review · Vina(前 3 构象)· 构象 QC · PLIP · ADMET · PDF/ZIP。可选 PyMOL 图(+0.5 积分/任务)。

体验包
¥12
微信扫码 · 一次性购买

适合 1–3 个配体的小作业

  • 2 积分(一次性)
  • 完整对接流水线:Vina · PLIP · ADMET · PDF/ZIP
  • 付款后约 30 分钟内人工到账
课程包
¥50
微信扫码 · 一次性购买

适合多次对接或小型批量筛选

  • 10 积分(一次性)
  • 完整对接流水线:Vina · PLIP · ADMET · PDF/ZIP
  • 付款后约 30 分钟内人工到账

Dock 积分如何运作

海外用户请使用英文站的 PayPal / 银行卡订阅与积分包。

Dock 积分如何运作

积分用于每次对接运行。订阅包含月度积分;一次性积分包为固定价格单独购买(见定价页)。两者可共存于同一账户。

每次对接运行消耗的积分

点击 Run docking 时,按配体数量从余额扣除积分——无论积分来自 Free、订阅还是一次性积分包。本节说明积分消耗,而非一次性积分包价格。

一次性积分包(Single Run、Screening Pack)在定价页「一次性」标签以固定价格出售,捆绑一定积分。结账时不按配体计费——下表说明每次运行对接时积分的使用方式。

  • 1–3 个配体:1 积分
  • 4+ 个配体:每 5 个配体 1 积分,向上取整(4–5 个配体 = 1 积分;12 个配体 = 3 积分)
  • PyMOL 发表级图:+0.5 积分/任务(可选)
  • 可选 AI 论文草稿(Gemini Discussion + 图注):+1 积分,对接完成后单独生成时计费
  • 示例:25 个配体 + PyMOL = 5 + 0.5 = 5.5 积分

每次运行消耗积分(参考)

配体数积分+ PyMOL
111.5
211.5
311.5
411.5
511.5

PyMOL 每任务 +0.5 积分。AI 论文草稿 +1 积分,对接后单独计费。适用于任何积分余额(Free、订阅或一次性)。其他批量规模:1–3 个配体 = 1 积分;4+ = 每 5 个配体 1 积分(向上取整)。

积分何时扣除

  • 提交对接任务时扣除积分(非完成时)
  • 始终优先使用订阅积分;当期订阅积分用尽后才使用一次性积分包积分
  • Free 方案:注册时一次性发放 1 积分(足够一次 1–3 配体任务,不含 PyMOL);未用积分不结转,且不会每月刷新。每邮箱一次积分发放;每设备与网络仅限一个 Free 账户。
  • 付费方案:月度订阅积分在每个计费周期开始时重置

升级订阅

  • 升级时(如 Student → Research),旧订阅自动取消——不会同时保留两个付费方案
  • 旧方案未用尽的订阅积分不结转;新方案以完整月度额度开始(如 Research = 40 积分)
  • 单独购买的一次性积分包积分在升级时不移除——保留在账户中直至使用

订阅与一次性积分包并存

  • 可同时购买订阅与一次性积分包——两者均保留在账户中
  • 一次性积分包:Single Run(2 积分)、Screening Pack(8 积分)。积分加入已购余额,按上述规则每次运行消耗
  • 一次性积分包积分不随月度周期过期;订阅积分每个计费周期重置(Free 注册积分为一次性,不按月发放)
  • 任务始终先消耗订阅积分,再消耗一次性积分
  • 需要更多月度用量时建议订阅或升级;一次性积分包始终在定价页作为备选

服务故障与积分退款

对接在我们的服务器上运行;您支付积分以执行计算并获取报告/ZIP。配体对接不成功(无效结构、预处理错误、无可用构象或单配体超时)属于正常科学结果——任务仍交付结果,积分不退还。若批量任务达到 3 小时上限,已完成配体以部分 ZIP 交付;未完成配体标记为 skipped——无部分积分退款。服务故障指平台无法完成或交付报告/ZIP(系统错误、崩溃或交付前超时)。此时该任务所扣积分全额自动退还(见积分历史)。批量任务提交时一次性按整批计费。订阅付款与任务积分分开。

结果存储

已完成任务按方案存储:Free 7 天,Student 14 天,Research 30 天,Lab 90 天。到期后文件删除——请本地保存 ZIP/PDF。Free 用户可从控制台延长一次或两次(每次 +14 天,0.5 积分)。

常见问题

Dock 如何处理配体质子化、加氢与部分电荷?

配体在任务质子化 pH(默认 7.4,可调 4.0–10.0)下由 dimorphite-DL 离子化。RDKit 3D 嵌入(ETKDGv3,多种子重试)时添加显式氢,随后 MMFF94 最小化(UFF 备用)。Meeko MoleculePreparation 在写入配体 PDBQT 时分配 AutoDock 原子类型与部分电荷。质子化 SMILES、pH、优化器与预处理警告记录在 run_manifest.json 中,并出现在 PDF Methods 部分。

阅读:受体与配体预处理

是否支持具有大量可旋转键的配体?

支持,在 AutoDock Vina 刚性受体对接的合理范围内。Meeko 在配体 PDBQT 中标记每个非末端可旋转键(报告为 TORSDOF)。Review setup 在超过 12 个可旋转键或 TORSDOF 时警告,超过 20 则拒绝。高柔性配体可能运行缓慢或构象采样不完整——可考虑更刚性类似物或其他平台的诱导契合方法。分子量上限 900 Da(超过 600 Da 警告)。

端到端对接流程是什么?

受体:RCSB PDB 下载(4 字符 PDB ID,如 6LU7)或用户上传 → Biopython 清理(去除水与共晶配体;可选保留 ZN/MG HETATM)→ Meeko Polymer 刚性受体 PDBQT。配体:SMILES 或 SDF → dimorphite-DL 质子化 → RDKit 3D 构象 → Meeko 配体 PDBQT。对接:AutoDock Vina(exhaustiveness 8,九种模式,energy range 3 kcal/mol),每个配体导出前三个构象。后处理:PLIP 蛋白-配体相互作用、PoseBusters 构象 QC、RDKit Lipinski/Veber/QED 摘要。

阅读:分步对接教程

受体是否柔性,还是仅配体柔性?

仅刚性受体对接:Meeko 受体预处理后蛋白侧链保持固定。配体柔性遵循 Meeko 可旋转键根(PDBQT 中的 TORSDOF)。本流程不支持诱导契合对接、柔性侧链、共价对接与膜蛋白工作流。

AutoDock Vina 搜索盒如何定义?

Review setup 时可选四种盒来源:(1) 共晶配体质心(holo 结构),(2) apo 口袋预测(pocketeer — 可选前三个口袋),(3) 口袋残基锚点(如 214,226,245),(4) 自定义 XYZ 中心。默认盒尺寸 20 × 20 × 20 Å。3D 预览在消耗积分前显示受体与搜索盒。Apo 口袋预测含明确免责声明,建议与文献或共晶结构对比。

Review setup(0 积分)在对接前验证什么?

Review setup 解析或下载受体、确定结合盒,并对配体运行预检(SMILES 有效性、分子量、可旋转键数、Meeko TORSDOF)及 3D 盒预览——不扣积分。此处生成的配体 PDBQT 在对接时复用(质子化锁定于验证步骤)。修复显示的错误后,Run docking 仅在提交时扣积分。

AutoDock Vina 设置是否固定?能否修改 exhaustiveness?

Vina 参数为可重复性固定:exhaustiveness = 8,num_modes = 9,energy_range = 3 kcal/mol,scoring function vina。每个配体导出评分最低的三个构象为 SDF 与蛋白-配体复合物 PDB。不支持自定义 exhaustiveness、Smina 或 GNINA 重评分——版本字符串与全部设置记录在 run_manifest.json 中,供 Methods 段落引用。

共晶 redock 健全性检查如何工作?

当上传 PDB 中存在共晶配体时,Dock 可对其 redock 并报告与晶体构象的重原子 RMSD。单配体任务默认启用;批量任务默认禁用(可在 Advanced 启用)。大 RMSD 在筛选类似物前提示结合盒设置错误、链选择错误或质子化不匹配。

分子对接是否一定需要晶体化蛋白结构?

不一定。Holo 晶体结构(蛋白与共晶配体)最适合定义结合位点与 redock 检查。许多学生项目可用 apo 结构加文献定义或预测口袋,前提是清楚说明假设。

阅读:对接是否需要晶体结构?

什么是分子对接?

分子对接预测小分子如何在蛋白结合位点结合,产生构象与评分(如 Vina 亲和力,单位 kcal/mol)。用于课程作业中的假设生成——非结合实验证据。

阅读:分步对接教程

分子对接如何工作?

在结合位点放置搜索网格;采样配体构象并由搜索算法评分。AutoDock Vina 使用刚性受体对接(蛋白固定,配体扭转柔性)。Dock 用 Meeko 准备受体与配体 PDBQT,并将 Vina 设置、盒坐标与质子化 pH 记录在 run_manifest.json 与 PDF 报告中。

阅读:对接流程教程

学生最适合的分子对接软件是什么?

AutoDock Vina 仍是教学实验室标准(快速、引用广泛)。Dock 在线运行 Vina,免去本地安装。GNINA 或 DiffDock 等替代方案增加 ML 评分,但设置与可重复性不同——大多数作业,Vina 加清晰 Methods 文字即符合评分预期。

阅读:AutoDock Vina 在线 vs 其他工具

如何在线运行分子对接?

输入 4 字符 PDB ID(或上传 .pdb 受体),提交 SMILES 或 SDF 配体,运行 Review setup(0 积分),然后点击 Run docking。您将收到 results.zip 包与 PDF 报告,含构象、PLIP 相互作用、构象 QC 及可选 PyMOL 图。

阅读:分步对接教程

results ZIP 文件包含什么?

results.zip 是离线工作的完整交付物。任务根目录:result.json(摘要)、run_manifest.json(Methods 用 Vina/盒/pH)、receptor_clean.pdb,适用时含 redock_report.json。每个已对接配体:前 3 构象(SDF)、蛋白-配体复合物(PDB)、配体 PDBQT、ADMET 与相互作用 JSON、PNG 图(2D diagram、overview、ligand 2D;可选 PyMOL 结合位点渲染)。PDF 报告镜像关键表格与图用于打印,但不替代 ZIP 结构文件。见首页 Features 下「results ZIP 包含什么」一节。

单配体 vs 批量:报告是否相同?所有化合物在哪里显示?

每个成功配体的流程相同——均有构象、复合物 PDB、ADMET JSON、相互作用 JSON 与 PNG 图。results.zip 中每个成功对接化合物有独立文件(不仅是最佳命中)。网页报告中结果表列出所有配体及评分与 QC;结合模式文字、发表级图、ADMET 详情与 3D 查看器一次显示一个配体——批量任务使用配体下拉(默认:最佳亲和力)。PDF 在表中列出所有配体,但主要嵌入最佳命中的图与讨论。可选 AI 手稿草稿也聚焦最佳命中。例外:批量任务启用 PyMOL 图时,仅最佳命中获得 PyMOL PNG(其他每配体交付物仍适用)。共晶 redock 单配体默认开启,批量筛选默认关闭。

对接任务的积分如何计算?

对接运行:1–3 个配体 1 积分,之后每 5 个配体 1 积分向上取整(4–5 = 1 积分,6–10 = 2 积分,依此类推)。可选 PyMOL 图每任务 +0.5 积分。点击 Run docking 时检查积分,任务入队前验证。

积分何时扣除?

提交对接任务时扣除积分,非完成时。仅当服务未能交付报告/ZIP(系统错误、崩溃或超时)时退款——单个配体无法对接不属于退款范围。

配体无法对接是否等于服务故障?

否。配体无法对接表示流程已运行但该分子无法预处理或评分(错误 SMILES、预处理错误、单配体超时等)——这是您付费测试的正常结果,积分不退。若批量达到 3 小时上限,您收到已完成配体的部分 ZIP;skipped 化合物列于报告中——仍无部分退款。服务故障指平台无法完成或交付任务(服务器错误、崩溃、无报告/ZIP 的超时)。服务故障全额退款。已完成批量中部分配体 skipped 仍属已交付任务——无部分退款。

何时退还积分?

仅服务故障:系统错误、崩溃或交付任何报告/ZIP 前的超时。查看控制台 → 积分历史中的退款记录。修复输入后重新提交。配体级别结果(无法对接、弱亲和力)不退款。

批量中部分配体无法对接,是否退还积分?

否。提交时按整批一次性扣积分。Skipped、超时或无法对接的配体是正常结果,列于报告中——不构成退款理由。若任务达到 3 小时上限,您仍收到已完成配体的部分 ZIP。仅当整批任务在我方侧完全失败且无交付物时退款。

订阅积分 vs 一次性积分包积分?

订阅积分每个计费周期重置,属于当前方案。一次性积分包(Single Run、Screening Pack)单独购买,不随月份过期,升级时不移除。运行任务时始终先用订阅积分;当期订阅积分用尽后才用一次性积分。

升级订阅会发生什么?

旧订阅自动取消——不会同时保留两个付费方案。旧方案未用订阅积分不结转;新方案以完整月度额度开始(如升级至 Research 得 40 积分)。单独购买的一次性积分包积分保留。升级前控制台会要求确认。

Dock 费用多少?

Dock 提供 Free 方案 $0/月(1 积分/月,无需信用卡)。付费月度订阅:Student $12/月(10 积分/月),Research $35/月(40 积分/月,2 并发,优先队列),Lab $99/月(150 积分/月,5 并发,优先队列)。无订阅的一次性积分包:Single Run $7.99(2 积分)与 Screening Pack $19.99(8 积分)。所有付费层级包含相同对接流程(Vina、PLIP、ADMET、PDF/ZIP)。定价与限制与本页定价部分所示一致。

Student、Research、Lab 方案包含什么?

Student($12/月):10 积分/月。Research($35/月):40 积分/月,2 并发,优先队列。Lab($99/月):150 积分/月,5 并发。批量规模由积分限制(每任务最多 300 配体)。所有方案包含完整对接流程。详见定价页。

能否不订阅直接购买积分?

可以。Single Run($7.99):2 积分。Screening Pack($19.99):8 积分。积分按配体数量每次运行消耗;并发与队列优先级遵循方案层级(见定价页)。

订阅退款政策是什么?

可随时取消订阅以停止未来扣款。过往订阅付款通常不退款,法律要求除外。对接任务积分分开:仅服务故障(未交付报告/ZIP)自动退款,配体无法对接不退款。

结果保留多久?

保留期取决于方案:Free 7 天,Student 14 天,Research 30 天,Lab 90 天。Free 用户可从控制台延长已完成任务两次(每次 +14 天,0.5 积分)。过期前请下载 ZIP 与 PDF。

平台活动

来自生产环境的公开指标——无营销包装。

12,450+
已完成对接运行
99.9%
Vina 任务成功率
42s
平均处理时间

数据来自生产日志 · 最近更新 2026 年 6 月