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Convertidor de nombre químico a SMILES
Genera al instante Canonical SMILES y una estructura 2D desde cualquier fármaco, producto natural o nombre IUPAC — listo para docking molecular.
Use nombres de fármacos en inglés o nombres IUPAC (p. ej. Aspirin). PubChem no admite nombres en chino u otros alfabetos no latinos.
Los resultados aparecerán aquí — SMILES, estructura 2D y enlace de acoplamiento con un clic.
Cómo convertir un nombre químico a SMILES
No necesita ChemDraw, Open Babel ni PubChem local. Este convertidor gratuito llama a la API PubChem PUG REST en su navegador y devuelve un SMILES listo para acoplamiento en segundos.
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Introduzca un nombre o sinónimo
Use un nombre común (Aspirin), INN, sinónimo comercial o IUPAC completo. Si falla el primer intento, prefiera el sinónimo más usado.
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Obtenga Canonical SMILES + estructura 2D
Resolvemos el nombre en PubChem, mostramos la representación 2D y el Canonical SMILES (conectividad) que puede copiar para notebooks, scripts o AutoDock Vina.
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Acople en línea con un clic
Haga clic en Acoplar con este ligando para abrir AutoDock Vina con el SMILES prefijado. Combínelo con un PDB ID (o use nuestro buscador PDB por nombre de proteína) y ejecute el acoplamiento en el navegador.
Compuestos populares que los estudiantes convierten a SMILES
Los trabajos de curso y el cribado virtual suelen empezar con moléculas conocidas. Haga clic en un nombre para obtener el SMILES en vivo de PubChem y acoplar contra su PDB objetivo.
| Compuesto | Uso típico | Notas |
|---|---|---|
| AINE / ligando didáctico | CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O | |
| Ácido carboxílico drug-like | CC(C)Cc1ccc(C(C)C(=O)O)cc1 | |
| Flavonoide de producto natural | Andamio polifenólico (consultar en vivo) | |
| Clásico inhibidor de quinasa | Ligando oncológico oral mayor | |
| Análogo nucleotídico | Antiviral / ejemplo era COVID | |
| Andamio esteroide | Ligando de anillos fusionados rígido |
¿Por qué convertir nombres químicos a SMILES para acoplamiento?
Los artículos y manuales nombran ligandos en inglés (“quercetin”, “remdesivir”), pero los motores de acoplamiento necesitan una estructura legible por máquina. SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System) codifica átomos y enlaces en una línea — sin SDF para un solo compuesto. Los flujos AutoDock Vina en línea suelen generar 3D, protonar a un pH dado y escribir PDBQT del ligando.
Buscar en PubChem por nombre es la forma más rápida de obtener un Canonical SMILES confiable sin ChemDraw. Esta página cubre la consulta de cola larga: conoce el compuesto, necesita la cadena y quiere acoplar — sin instalar RDKit u Open Babel localmente.
Tras la conversión, empareje el ligando con un PDB ID de receptor. Si solo conoce el nombre de la proteína (EGFR, ACE2, CDK2), use nuestra herramienta de búsqueda PDB por nombre de proteína y ejecute el acoplamiento en la página principal de Dock.
Preguntas frecuentes: nombre a SMILES
Respuestas breves para estudiantes que convierten nombres de fármacos, IUPAC y sinónimos en SMILES listos para acoplamiento.
SMILES es una notación compacta de estructuras moleculares. Átomos y enlaces se escriben como caracteres — por ejemplo aspirin suele ser CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O. Anillos, ramas, cargas y estereoquímica caben en una línea que bases de datos y herramientas de acoplamiento pueden parsear.
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