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Conversor de SMILES
SMILES a SDF o MOL, archivos de estructura de vuelta a SMILES, o un nombre químico a una línea SMILES.
Suelta un archivo de estructura
.sdf / .mol / .pdb / .smi — la conversión queda en el navegador
La primera vez se descarga Open Babel. Después, la conversión sigue en este dispositivo.
Resultado
El resultado aparece aquí. SDF y MOL también se descargan.
Cómo convertir SMILES
SMILES es una línea de texto de la molécula. SDF y MOL son los archivos de estructura que piden la mayoría de programas de dibujo y de preparación para docking. Esta página convierte entre esos formatos en el navegador y puede buscar un nombre en PubChem.
- 1
Elige la dirección
SMILES → SDF o MOL genera un archivo 3D (hidrógenos a pH 7.4). SDF / MOL / PDB → SMILES devuelve la línea. El nombre químico usa PubChem.
- 2
Pega o sube
Un SMILES por línea sirve para un lote pequeño. Para archivos, suelta SDF, MOL o PDB.
- 3
Descarga o haz docking
Copia el SMILES, descarga la estructura o envíalo a AutoDock Vina en Dock. El PDBQT para Vina local está en otro conversor.
Prueba una molécula
Rellenan el formulario. No se guardan.
| Compuesto | Uso habitual | Qué obtienes |
|---|---|---|
| Fármaco pequeño, primera prueba | SMILES ↔ SDF compacto | |
| AINE de prácticas | Cadena flexible, tamaño de ligando | |
| Heterociclo rígido | SMILES corto, 3D limpio | |
| Flavonoide de producto natural | Ligando habitual en cursos |
Qué conversor usar
Usa esta página para “conversor SMILES”: tienes SMILES y necesitas SDF o MOL, o tienes un archivo y necesitas la línea SMILES. Nombre químico a SMILES es la misma consulta PubChem.
El SMILES o SDF de aquí entra en el formulario de AutoDock Vina. No es un PDBQT. Para la línea de comandos local usa el conversor PDBQT, o acopla en línea.
Preguntas sobre la conversión SMILES
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